Средняя школа № 63 является победителем регионального этапа конкурсного отбора в рамках ПНПО в 2008 году. С 2003 года школа принимала участие в эксперименте по отработке ЕГЭ. С 2004 года школа является федеральной экспериментальной площадкой по введению предпрофильного и профильного обучения. С 2005 года на базе школы проходит эксперимент по введению новой формы проведения экзамена по русскому языку, а с 2008 года – эксперимент по введению новой формы проведения экзамена по алгебре для выпускников основной школы. Приоритет в учреждении в среднесрочной перспективе отдается экологическому образованию, вариативности образования, сохранению единого образовательного пространства.