За период 1996–2019 г.г. произведено 466 пересадок почек, в их числе 365 трансплантаций почки от посмертных доноров, 101 – от живых родственных доноров. По показателям трансплантации почки Республика Башкортостан занимает второе место в Приволжском федеральном округе, по РФ – десятое место. По деторождению среди трансплантированных пациентов больница занимает первое место среди регионов ПФО. В 2013 году в отделении произведены первые трансплантации печени.