Музейный фонд составляет более 250 тыс. предметов. Этнографическая, зоологическая, энтомологическая, минералогическая, нумизматическая и многие другие коллекции предполагают высокий уровень экскурсионного обслуживания посетителей. Научными сотрудниками, методистами разработано свыше 200 тематических экскурсий. Ежегодно разрабатываются новые темы программного обучения учащихся, а внемузейные экскурсии по Ставрополю и выставки позволяют разнообразить тематику экскурсий. Музей- заповедник, включающий 14 филиалов, является научным, консультационно-методическим центром Северо-Кавказского региона.